Hay que partir de que MooTools y jQuery son dos filosofías diferentes para afrontar problemas similares. Por ese motivo hay quien le gusta más uno que otro.
@Punkesito: Completamente de acuerdo. El problema es que los navegadores no se actualizan a la velocidad que desearíamos.
@Jose: a ver por partes:

1) Sizzle es celebre por que lo ha desarrollado quien lo ha desarrollado nada más. Es una muestra de dominio del lenguaje y estoy contigo en que es un desarrollo muy sucio y dificil de entender.

2) No creo que debamos puntuar un framework por lo fácil que sea entender su código ya que eso lo necesita una minoría. Creo que es más importante que funcione, que lo haga bien y rápido antes que la claridad del código.

Ojo!, que si encima está bien estructurado y es claro mejor, pero para mi son cosas prescindibles, su finalidad es otra.

Respecto a ese útimo asunto, ¿merece la pena mantener tal infrastructura en memoria, incluso en los casos en los que no será necesaria, simplemente para ahorrar un cacheo expreso por parte del programador?¿Tan vagos somos? Me explico con un ejemplo:

$('#osbourne').find('.kate').css({'background-color' : 'yellow'}).end().css({'background-color' : 'blue'})

z = franki.get('#osbourne');
z.get('.kate').css({'background-color' : 'yellow'});
z.css({'background-color' : 'blue'});

Que me digáis que está bien mantener el asunto de la pila por ahorrarnos la z y presumir de que nos gusta el rollo de las monads y las arrows creo que es el colmo de la vagancia y la pedanteria

Y aunque no he usado MooTools, reconozco que esta muy bien estructurado de forma modular y que de base inclulle más cosas que jQuery. La razón por la que uso jQuery es su facilidad de uso a la hora de seleccionar elementos e iterar por ellos (MooTools tambien es facil pero escribiendo 2 lineas más).

1. Interfaz: todos los modulos dedicados a selección CSS presentan la misma interfaz: tomar un selector y devolver una lista de nodos. No es un criterio para comparar.
2. Selectores soportados.
3. Las diferencias en tiempos de ejecución (sin utilizar caches, por favor)
4. Estructura y claridad del código.

Pués eso, ¿por qué Sizzle es tan celebre?

Por otra parte, por supuesto que jQuery y MooTools no son totalmente comparables. Como otras veces he comentado, jQuery en la práctica es un DSL extensor de CSS con soporte para HttpRequest. MooTools está en la liga de Prototype y otros grandes. Pero de todas formas podemos comparar como están programados y jQuery/Sizzle son más díficiles de entender que las cosas que salen del equipo de Proietti. Y cuando uno quiere adaptar personalmente (vicios que tiene uno ) código de otros es importante que las cosas esten claras, y no tener que torear haks pretenciosos y ofuscantes.

El que te guste el código más o menos es algo muy personal, a mi MooTools me gusta como está estructurado pero no lo considero la opción más acertada para el Javascript que necesito programar.

El selector CSS Sizzle, está d.p.m. y eso no se lo puede quietar nadie. Valerio no lo quiere incorporar por los motivos que comenta, encambio la Dojo Company si que lo está barajando por otros motivos.